RELATEED CONSULTING
相关咨询
选择下列产品马上在线沟通
服务时间:8:30-17:00
你可能遇到了下面的问题
关闭右侧工具栏

新闻中心

这里有您想知道的互联网营销解决方案
LeafcircBase数据库怎么用

这篇文章主要介绍LeafcircBase数据库怎么用,文中介绍的非常详细,具有一定的参考价值,感兴趣的小伙伴们一定要看完!

让客户满意是我们工作的目标,不断超越客户的期望值来自于我们对这个行业的热爱。我们立志把好的技术通过有效、简单的方式提供给客户,将通过不懈努力成为客户在信息化领域值得信任、有价值的长期合作伙伴,公司提供的服务项目有:主机域名虚拟主机、营销软件、网站建设、泉州网站维护、网站推广。

LeafcircBase收录了以下5种植物模式生物的环状RNA信息

  1. Arabidopsis thaliana

  2. Glycine max

  3. Oryza sativa

  4. Triticum aestivum

  5. Zea mays

采用以下两款软件来预测环状RNA

  1. find_circ

  2. circRNA_finder

通过官网的Browse菜单,可以浏览不同物种对应的环状RNA数据

LeafcircBase数据库怎么用

以拟南芥为例,结果示意如下

LeafcircBase数据库怎么用

点击来源基因的名称,可以跳转到对应的数据库。点击右上角的Download按钮,可以下载所有结果,点击Datails可以查看环状RNA的详细信息,示意如下

LeafcircBase数据库怎么用

可以看到对应的软件。如果在其他物种中存在同源,还会列出同源环状RNA的信息,示意如下

LeafcircBase数据库怎么用

通过该数据库,不仅可以查看植物中环状RNA的信息,还可以查看在不同物种间的同源性。

该数据库中的结果是可以下载的,在下载的excel文件中,还可以看到每个环状RNA对应的样本在SRA数据库中的编号。

以上是“LeafcircBase数据库怎么用”这篇文章的所有内容,感谢各位的阅读!希望分享的内容对大家有帮助,更多相关知识,欢迎关注创新互联行业资讯频道!


网页标题:LeafcircBase数据库怎么用
文章地址:http://scyingshan.cn/article/jgiieo.html